El Museu conserva peces del taller del Mestre Bartomeu de Girona, el primer escultor amb nom conegut i introductor del gòtic a Catalunya. A partir de 1320, l’alabastre de Beuda (La Garrotxa) es va convertir en el material preferent de l’escultura de culte. Al Museu podem veure obres atribuïdes a mestres reials com Jaume Cascalls, i un relleu de Pere Oller. 

El Saló del Tron reuneix un dels conjunts de retaules del segle XV més destacats de Catalunya, amb obres de Lluís Borrassà, Bernat Martorell i Jaume Cabrera, entre d’altres.

La col·lecció es completa amb tombes, relleus i capitells dels tallers gironins.