Les obres d'aquest període estan marcades pel seu caràcter religiós: mobiliari litúrgic, escultura i decoració monumental, realitzades principalment en monestirs i centres catedralicis. Aquests espais van ser, durant segles, els principals focus de creació artística dels comtats pirinencs i prepirinencs; d'aquests, els situats al nord-est formaven part del bisbat de Girona. 

Entre les peces més destacades s’hi troben el conjunt litúrgic de Sant Pere de Rodes, la Biga de Cruïlles i el cap de marbre atribuït al taller del Mestre de Cabestany. 

Finalment, el visitant pot descobrir un dels símbols més reconeguts i enigmàtics de la Girona actual: l’autèntica columna amb el relleu de la Lleona, datada del segle XIII.